Cerkev je bila zgrajena okoli leta 1500 v času turških vpadov, na mestu kapelice materi Božji Mariji, prej postavljene leta 1429. Zidovje cerkve je izredno debelo in močno, zgrajeno v baročnemu stilu, dolžine 21 metrov in širine 8 metrov. Okoli leta 1700 je bila zgradba obnovljena. V istem času naj bi bila posajena tudi lipa, katere deblo danes meri v obsegu preko 5,2 metra.
Cerkev krasijo trije oltarji. Glavni oltar svetega Janeza Krstnika, ki krsti Jezusa v reki Jordan; evangelijski oltar Marije Brezmadežne device; na epistelski strani je oltar Antona Puščavnika. V prostoru najdemo Križev pot slikarja Antona Postla, izdelan v drugi polovici 19. stoletja, z napisi v bohoričici.
Poleg cerkvenega praznika svetega Janeza Krstnika, 24. junija, praznujejo v Gabrju tudi praznik svetega Antona, 17. januarja, v spomin na živinsko kugo leta 1864.
(vir: šematizem in https://pokopaliscegabrje.wixsite.com/iskalnikgrobov/zgodovina)